Das St. Elisabeth-Krankenhaus Köln-Hohenlind ist seit 2007 nach "proCum Cert inklusive KTQ" zertifiziert. Das Onkologische Zentrum ist seit 2020 durch die Deutsche Krebsgesellschaft zertifiziert. Das Brustzentrum ist von der Ärztekammer-Westfalen-Lippe seit 2006 zertifiziert. Das Darmzentrum wurde erstmals 2011 von der Deutschen Krebsgesellschaft zertifiziert. 2014 folgte die erfolgreiche Zertifizierung des Pankreaszentrums. Das Gynäkologische Krebszentrum ist seit 2014 durch die Deutsche Krebsgesellschaft erfolgreich geprüft und zertifiziert. Das Kopf-Hals-Tumorzentrum ist seit 2020 durch die Deutsche Krebsgesellschaft zertifiziert. Das Prostatakrebszentrum ist seit 2021 durch die Deutsche Krebsgesellschaft zertifiziert. Die Gynäkologische Klinik ist erfolgreich als "Klinisches Endometriosezentrum" ausgezeichnet worden. Die Schmerztherapie im St. Elisabeth-Krankenhaus ist seit 2011 mit dem Zertifikat "Certkom - qualifizierte Schmerztherapie" ausgezeichnet. Die erfolgreiche Zertifizierung als "Lokales Traumazentrum" im TraumaNetzwerk DGU® erfolgte 2018. Das Prostatazentrum ist seit 2018 nach URO-Cert ausgezeichnet.